他一个入诏狱待查的，没人搭理他。
等乾清宫的宦官拿着王安的手令来提方从哲的时候，接班的人还不知道首辅进诏狱了呢。
方从哲跟着宦官再度进乾清宫，这一天对他的上上下下刺激可真够大的了。早晨还是群臣之首，没多久拥立天子登基后自己就是阶下囚了。但他怎么也想不明白，那李可灼怎么就成了自己推荐的了呢？
在乾清宫新帝接受礼拜的时候他不敢喊冤。一个是他被新君杀人的狠厉吓住了，怕自己贸贸然开口被新帝当场斩杀了。二则是新君甫登基而首辅就喊冤，与新君百害无一利，对喜酒也是同样。
反正是入狱待查。入诏狱也不是什么难看的事儿。
真得佩服方从哲的心劲了。
王安守在屋子的门口看着新君小憩，有小内侍悄悄地过来，在他手心画了韩爌两字，然后耳语道：“求见。”
“等着。”
王安低声叱责。他很不悦，连带对小内侍也无好声气。
那小内侍就说：“是为方首辅。”
俩人自以为说话声很低，可是也惊扰了浅眠的天子。
朱由校睁开眼睛，问王安，“什么事儿？”
王安没办法了，只好上前回答：“是阁臣韩爌求见。”
朱由校皱眉，“还有阁臣？他上午怎么没来？”
王安躬身说道：“韩大人昨天被打伤了。现为方首辅之事求见。”
“那就叫进来吧。”
韩爌居然是被背进来的。
朱由校赶紧说道：“既是病了，就在家休养好了。快给韩大人置座。”
但韩爌还是坚持着给新君叩头。
“陛下，臣有负先帝所托，今日未能再来乾清宫迎陛下登基。”
“先起来坐着说话吧。可有请太医看诊？”
韩爌略摇头却立即停住动作，“臣不是生病，而是昨日被乾清宫内宦的棍棒击中了头部，之后眩晕不敢移动。才听说方从哲被李可灼之事牵连，赶来宫里与陛下说明所知情况。”
“好，你坐下说吧。”
韩爌慢慢把李可灼在八月二十二日到内阁值房求见，想献仙丹与先帝，被方从哲阻拦，自己与刘一燝均在场说了。
“后来八月二十九日，先帝召内阁等人包括杨涟在内觐见，问起仙丹之事。方从哲说仙丹之事内阁不敢信，但先帝要见李可灼。”
“你是说方从哲没有推荐李可灼，而且不止你一个人知道？”
“是。”
“为什么朕将方从哲下诏狱，没人说话？”
韩爌为难，“臣当时不曾在场，或许稍后其他人会与陛下说明。陛下说的也是待查。且方从哲为首辅，没拦下先帝用红丸也还是有责任的。”
朱由校摇头，“父皇那时候大概是抱着死马当成活马医的思想了。倒是朕不该信了传言，误会了方首辅。”
韩爌没想到新君能立即认错，对朱由校抱拳说：“难为陛下了。”
朱由校便道：“此事朕已明了，你放心回去休息吧，回头让太医过府给你看看。”
韩爌再要跪下磕头，王安赶紧在天子的示意下去扶住他，叫了两个大力宦官背负着韩爌出去了。
韩爌才出乾清宫，就遇到被宦官领进来的方从哲。
方从哲知道韩爌受伤，赶上去问道：“你不府里好好养伤，怎么又进宫了？”
“我是为你啊。他们和你一样在礼拜的时候不好驳新君，我这个今天在家休养的人，最适合进来与天子讲明情况。”
方从哲感动，对着韩爌一躬到底，“虞臣恩义，老夫不敢或忘。”
韩爌挣扎着要给方从哲回礼，“此乃道义应为之事，可不敢当首辅之礼。”
方从哲赶紧拦住他，“你快回府去吧。天子相召想必已经没事儿了。”
果然，方从哲在见了天子之后，得了一番安抚，然后从容回去内阁值房，他仍旧是大明的首辅。
内阁值房里，众人见了他回来也不见怪，纷纷上前道喜，打趣他是进诏狱却出来最快的一位。嘻嘻哈哈笑完以后，众人把天子召六部七卿所议之事告诉给他。
方从哲赶紧说：“大家尽管去忙，今晚老夫就在这儿值夜了。”
刘一燝说道：“方首辅，你还是回府比较好。免得府里被锦衣卫围了半天，家人都担惊受怕的。今夜我来值夜好了。”
方从哲对刘一燝抱拳，“多谢季晦体恤。”
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红丸案
泰昌元年(1620年)八月二十九日，鸿
胪寺丞李可灼说有仙丹要呈献给皇上。太监们不敢做主，将事情禀告内阁大臣方从哲。
方从哲说:"彼称仙丹，便不敢信。"
接着，内阁大臣们进乾清宫探视朱常洛。朱常洛此时已着意安排后事，将皇长子交由阁臣小心辅佐，又问起自己的陵墓的营建事宜。
在安排好一切之后，朱常洛问:"有鸿胪寺官进药，何在?"
方从哲说:"鸿胪寺丞李可灼自云仙丹，臣等未敢轻信。"
朱常洛自知命在旦夕，遂抱着试一试的想法，命李可灼入宫献药。
到中午时分，李可灼调制好一颗红色药丸，让皇帝服用。朱常洛服完红丸后，感觉还好，让内侍传话说:"圣体用药后，暖润舒畅，思进饮膳。"
傍晚，朱常洛命李可灼再进一粒红丸。
尽管御医们都表示反对，但是朱常洛坚持要再服一颗。
于是，李可灼再让皇帝服用了一颗红丸。服后，朱常洛感觉安适如前，没有什么不良反应。
泰昌元年九月二十六日(1620年)五更，朱常洛驾崩。
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